MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 34856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018938	CAT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018938	T	6	6	190	195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018938	TGAG	2	8	233	240	25 %	25 %	50 %	0 %	410501006
4	NC_018938	CATT	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	410501006
5	NC_018938	GAT	3	9	328	336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501006
6	NC_018938	T	6	6	465	470	0 %	100 %	0 %	0 %	410501006
7	NC_018938	AAAGCG	2	12	494	505	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410501006
8	NC_018938	GTTG	2	8	507	514	0 %	50 %	50 %	0 %	410501006
9	NC_018938	T	7	7	524	530	0 %	100 %	0 %	0 %	410501006
10	NC_018938	T	7	7	552	558	0 %	100 %	0 %	0 %	410501006
11	NC_018938	TTC	2	6	562	567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501006
12	NC_018938	ACA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501006
13	NC_018938	C	6	6	606	611	0 %	0 %	0 %	100 %	410501006
14	NC_018938	CAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501007
15	NC_018938	C	6	6	848	853	0 %	0 %	0 %	100 %	410501007
16	NC_018938	CT	3	6	897	902	0 %	50 %	0 %	50 %	410501007
17	NC_018938	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501007
18	NC_018938	TAAAA	2	10	914	923	80 %	20 %	0 %	0 %	410501007
19	NC_018938	CTT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501007
20	NC_018938	TCTG	2	8	1016	1023	0 %	50 %	25 %	25 %	410501007
21	NC_018938	TGA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501007
22	NC_018938	AAAT	2	8	1118	1125	75 %	25 %	0 %	0 %	410501008
23	NC_018938	AAC	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501008
24	NC_018938	CCG	3	9	1249	1257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501008
25	NC_018938	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501008
26	NC_018938	GCT	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501008
27	NC_018938	CA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	0 %	50 %	410501008
28	NC_018938	T	6	6	1449	1454	0 %	100 %	0 %	0 %	410501008
29	NC_018938	TC	3	6	1491	1496	0 %	50 %	0 %	50 %	410501008
30	NC_018938	T	6	6	1553	1558	0 %	100 %	0 %	0 %	410501008
31	NC_018938	GGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501008
32	NC_018938	GCTT	2	8	1661	1668	0 %	50 %	25 %	25 %	410501008
33	NC_018938	CT	3	6	1767	1772	0 %	50 %	0 %	50 %	410501008
34	NC_018938	TAAAA	2	10	1807	1816	80 %	20 %	0 %	0 %	410501008
35	NC_018938	GTT	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501008
36	NC_018938	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501008
37	NC_018938	A	7	7	1983	1989	100 %	0 %	0 %	0 %	410501009
38	NC_018938	ATTATA	2	12	2001	2012	50 %	50 %	0 %	0 %	410501009
39	NC_018938	CCTG	2	8	2016	2023	0 %	25 %	25 %	50 %	410501009
40	NC_018938	ATG	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501009
41	NC_018938	CCAA	2	8	2040	2047	50 %	0 %	0 %	50 %	410501009
42	NC_018938	ATTC	2	8	2057	2064	25 %	50 %	0 %	25 %	410501009
43	NC_018938	TGAA	2	8	2080	2087	50 %	25 %	25 %	0 %	410501009
44	NC_018938	GTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501009
45	NC_018938	GC	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	410501009
46	NC_018938	T	6	6	2182	2187	0 %	100 %	0 %	0 %	410501009
47	NC_018938	CTT	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501009
48	NC_018938	TGG	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501009
49	NC_018938	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501009
50	NC_018938	G	6	6	2395	2400	0 %	0 %	100 %	0 %	410501009
51	NC_018938	CA	3	6	2481	2486	50 %	0 %	0 %	50 %	410501009
52	NC_018938	ATTC	2	8	2555	2562	25 %	50 %	0 %	25 %	410501009
53	NC_018938	GTTT	2	8	2633	2640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018938	A	8	8	2747	2754	100 %	0 %	0 %	0 %	410501010
55	NC_018938	TCTT	2	8	2763	2770	0 %	75 %	0 %	25 %	410501010
56	NC_018938	T	7	7	2843	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	410501010
57	NC_018938	TGA	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501010
58	NC_018938	T	7	7	2885	2891	0 %	100 %	0 %	0 %	410501010
59	NC_018938	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501010
60	NC_018938	GC	3	6	2996	3001	0 %	0 %	50 %	50 %	410501010
61	NC_018938	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	410501010
62	NC_018938	AG	3	6	3153	3158	50 %	0 %	50 %	0 %	410501010
63	NC_018938	GTG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501010
64	NC_018938	CAAA	2	8	3306	3313	75 %	0 %	0 %	25 %	410501010
65	NC_018938	GTG	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501010
66	NC_018938	GCC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501010
67	NC_018938	TTG	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501011
68	NC_018938	AG	3	6	3433	3438	50 %	0 %	50 %	0 %	410501011
69	NC_018938	GAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501011
70	NC_018938	GAAA	2	8	3528	3535	75 %	0 %	25 %	0 %	410501011
71	NC_018938	GTT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501011
72	NC_018938	CA	3	6	3981	3986	50 %	0 %	0 %	50 %	410501011
73	NC_018938	A	6	6	4022	4027	100 %	0 %	0 %	0 %	410501011
74	NC_018938	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501011
75	NC_018938	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	410501011
76	NC_018938	ATT	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501011
77	NC_018938	TGT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501011
78	NC_018938	TGG	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501011
79	NC_018938	GGT	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018938	TAT	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018938	TGG	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018938	ATGC	2	8	4486	4493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018938	TGG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018938	GTG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018938	ACC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018938	GGT	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018938	T	8	8	4802	4809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018938	AAT	2	6	4823	4828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018938	TAAA	2	8	4891	4898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018938	A	6	6	4896	4901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018938	TAT	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501012
92	NC_018938	T	7	7	4964	4970	0 %	100 %	0 %	0 %	410501012
93	NC_018938	A	6	6	4979	4984	100 %	0 %	0 %	0 %	410501012
94	NC_018938	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501012
95	NC_018938	T	7	7	5031	5037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018938	A	6	6	5042	5047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018938	A	6	6	5058	5063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018938	TTTTA	2	10	5116	5125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018938	A	6	6	5167	5172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018938	A	7	7	5181	5187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018938	A	8	8	5198	5205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018938	TCGC	2	8	5377	5384	0 %	25 %	25 %	50 %	410501013
103	NC_018938	ATTC	2	8	5406	5413	25 %	50 %	0 %	25 %	410501013
104	NC_018938	CATT	2	8	5450	5457	25 %	50 %	0 %	25 %	410501013
105	NC_018938	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501013
106	NC_018938	C	6	6	5535	5540	0 %	0 %	0 %	100 %	410501013
107	NC_018938	TGG	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501013
108	NC_018938	A	7	7	5682	5688	100 %	0 %	0 %	0 %	410501013
109	NC_018938	ATA	2	6	5691	5696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501013
110	NC_018938	TCT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501013
111	NC_018938	T	6	6	5714	5719	0 %	100 %	0 %	0 %	410501013
112	NC_018938	A	6	6	5724	5729	100 %	0 %	0 %	0 %	410501013
113	NC_018938	GTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
114	NC_018938	TAA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501013
115	NC_018938	TTA	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501013
116	NC_018938	GTG	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501013
117	NC_018938	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
118	NC_018938	GC	3	6	6030	6035	0 %	0 %	50 %	50 %	410501013
119	NC_018938	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501013
120	NC_018938	TTGAT	2	10	6052	6061	20 %	60 %	20 %	0 %	410501013
121	NC_018938	C	6	6	6134	6139	0 %	0 %	0 %	100 %	410501013
122	NC_018938	AGT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501013
123	NC_018938	T	6	6	6240	6245	0 %	100 %	0 %	0 %	410501013
124	NC_018938	GCTTGC	2	12	6274	6285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501013
125	NC_018938	CAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501013
126	NC_018938	GTT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
127	NC_018938	AC	3	6	6459	6464	50 %	0 %	0 %	50 %	410501013
128	NC_018938	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501013
129	NC_018938	TAG	8	24	6593	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501013
130	NC_018938	TTA	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501013
131	NC_018938	TGT	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
132	NC_018938	TTG	2	6	6717	6722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
133	NC_018938	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
134	NC_018938	CCG	2	6	6920	6925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501013
135	NC_018938	T	6	6	6968	6973	0 %	100 %	0 %	0 %	410501013
136	NC_018938	ATCG	2	8	7008	7015	25 %	25 %	25 %	25 %	410501013
137	NC_018938	GCT	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501013
138	NC_018938	CGTT	2	8	7043	7050	0 %	50 %	25 %	25 %	410501013
139	NC_018938	TTGA	2	8	7056	7063	25 %	50 %	25 %	0 %	410501013
140	NC_018938	GTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
141	NC_018938	T	6	6	7116	7121	0 %	100 %	0 %	0 %	410501013
142	NC_018938	A	6	6	7182	7187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_018938	T	7	7	7252	7258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_018938	CTT	2	6	20201	20206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501024
413	NC_018938	ATG	2	6	20276	20281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501024
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465	NC_018938	TTTA	2	8	22777	22784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_018938	A	6	6	23222	23227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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